Руководство Косаковского тоже не стало ни долгим, ни славным. У чиновника не заладились отношения с тогдашним президентом Леонидом Кучмой, и через два года главой Киевской горгосадминистрации назначили Александра Омельченко. В течение 1996-1997 годов Косаковский рулил Киевсоветом, но в итоге депутаты выразили ему недоверие. Фактическим руководителем столицы стал Сан Саныч, как за глаза называли киевского мэра Омельченко.
Провести следующие выборы помешали изъяны законодательства: нежелание Верховной Рады принимать Закон «О городе-герое Киеве» заставило в 1998-м городские власти перенести их на неопределенный срок. В следующем году парламент все-таки принял необходимый документ, и волеизъявление состоялось. Победу снова одержал Омельченко.
Победил он и в 2002-м. Причем уже в первом туре: тогда за действующего мэра столицы проголосовали 63,7% избирателей. Однако в 2006 году, вопреки всем прогнозам, он уступил Леониду Черновецкому, которому симпатизировали 32% избирателей. Спортсмен Виталий Кличко пришел к финишу вторым с 24% голосов. За Омельченко высказалась лишь пятая часть киевлян. Главной причиной, по которой люди решили отправить бессменного Сан Саныча в отставку, послужила бесконтрольная застройка исторического центра Киева.